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1. Brainnetome Atlas Viewer (V1.0) 

Brainnetome Atlas Viewer 是基于matlab平台开发的软件,其主要功能是查询及展示脑网络组图谱。 首先,该软件可以以二维和三维的方式呈现脑区亚区的最大概率图、概率图以及解剖与功能连接模式;其次,用户可以使用该软件提取感兴趣脑区及其亚区,用于后续分析。目前该软件已经推出v1.0版本,可公开免费下载。详细情况可关注脑网络组图谱网站(http://atlas.brainnetome.org/)。

 

图1. Brainnetome Atlas Viewer 

2. Brainnetome fMRI toolkit (BRAT) 

Brainnetome fMRI toolkit 是基于matlab平台和SPM库开发的工具包,其主要功能是利用神经影像数据计算和重构脑网络,从而刻画脑网络构架的属性。它具有自己独立的GUI,包括预处理、功能连接计算、网络属性计算、网络化视图、统计分析等多个功能。Brat适用于fMRI影像数据。目前该工具包已经推出v3.0版本,可公开免费下载(http://brant.brainnetome.org)。

图2. BRANT 3.0 

 

3. DiffusionKit, 一站式的diffusion MRI数据分析小型工具包 

该工具包基于C/C++写成,调用了部分VTK, OpenCV, CImg库函数功能。具有体积小、功能全、运行快等特点。具体的能报包括DWI数据矫正、预处理、建模分析(DTI和HARDI,支持single-shell和multi-shell数据,如美国HCP的数据)、纤维跟踪统计、网络构建,以及各种数据的可视化,包括3D, 4D, ODF, fiber track等数据的可视化。具体信息请访问网站 http://diffusion.brainnetome.org/

4. DTI Tracking System 

DTI Tracking System是一款针对扩散MRI影像数据的分析软件,它包括DTI数据的一些常规处理,例如张量模型重构,张量解算,确定性纤维跟踪及概率性纤维跟踪。该软件可以在windows XP/VISTA/7/8操作系统中使用,目前已推出v1.0版本,可以免费下载。

图3. DTI Tracking System